征信机构查询记录通常会在两年后自动删除。根据《征信业管理条例》第十六条的规定，征信机构对个人不良信息的保存期限自不良行为或者事件终止之日起为5年；超过5年的，应当予以删除。然而，对于查询记录而言，征信报告上一般只会显示近两年的明细，并且实行覆盖式记录，即新的查询会覆盖掉旧的查询记录。
需要注意的是，虽然查询记录在征信报告上通常只保留两年，但如果有不良信贷记录，如逾期情况，该记录将被保留5年。
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